Sếu đầu đỏ là một trong những loài chim quí hiếm được ghi vào sách đỏ, hiện được các tổ chức bảo tồn bảo vệ nghiêm ngặt
.
Dự đoán đàn sếu sẽ về đông nhất vào đầu tháng 5/2011 với hàng trăm con. Đặc biệt năm nay sếu về tập trung khu A1 bởi cánh đồng năng um tùm đã bị đốt cháy, hiện có nhiều củ năng non là món mồi ngon cho sếu đầu đỏ. Không chỉ có loài sếu về sinh sống mà VQGTC có môi trường tốt thu hút 231 loài chim nước, trong đó có 16 loài chim quý hiếm đang được bảo vệ .
Để bảo vệ các loài động, thực vật phát triển, nhất là sếu đầu đỏ bay về trong mùa này, Ban quản lý VQGTC luôn chú trọng điều tiết nước, nhất là các bãi ăn của sếu ở khu A1, A3, A4 và A5. Lực lượng bảo vệ thường xuyên túc trực 24/24 giờ nơi có sếu về ở, nghiêm cấm các hoạt động săn bắt. Môi trường tự nhiên vườn QGTC được cải thiện đáng kể, mực nước các khu vực đảm bảo theo chuẩn nên các loài thủy sinh, thủy sản phát triển nhanh, thảm thực vật cũng được phục hồi và phát triển nhanh trong mùa lũ, trong đó có trên 500 ha lúa trời (lúa ma) được bảo tồn. Đây là điều kiện thích hợp để các loài chim về đây quần tụ kiếm ăn sau khi nước lũ rút.